2008年の活動

まとめ

2008年の活動をふりかえります。

原著論文

  1. OUP | Not Found - 研究開発創作日誌
  2. Low conservation and species-specific evolution of alternative splicing in humans and mice: comparative genomics analysis using well-annotated full-length cDNAs | Nucleic Acids Research | Oxford Academic - 研究開発創作日誌

論文引用

査読付き論文の2008年に引用された回数と累積回数をカウントします。

# ISI2008 累積 GS2008 累積 内容
1 Yada et al. 1999 BIOINFORMATICS +6 54 TBD 90 大腸菌遺伝子発見をHMMで
2 Nakao et al. 1999 GIW TBD TBD +7 44 遺伝子発現をKEGG/PATHWAYに
3 Makita et al. 2004 NAR TBD TBD TBD TBD DBTBS
4 Imanishi et al. 2004 PLoS Biol. TBD TBD TBD TBD H-Invitational
5 Nakao et al. 2005 NAR TBD TBD +6 17 ヒトスプライスバリアント分類
6 Takeda et al. 2006a NAR TBD TBD TBD TBD ヒトAS
7 Takeda et al. 2006b NAR TBD TBD TBD TBD H-ASDB
8 H-Invitationa 2. 2007 NAR TBD TBD TBD TBD H-Invitational 2
9 Sato et al. 2008 DNA Res. TBD TBD +3 3 ミヤコグサゲノム
10 Takeda et al. 2008 NAR TBD TBD TBD TBD ヒトとマウスのASエクソン比較

ウェブサイト

# 2008アクセス数
1 http://b-src.cbrc.jp TBD
2 http://a.kazusa.or.jp TBD
3 http://bacteria-genome.kazusa.or.jp TBD
4 研究開発創作日誌 5,057
5 KazusaAPI開発日誌 - KDRIグループ 6,924
6 "aac".translate #=> "N" - BioRuby Group 1,997

著作物

オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス

オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス

講義

  1. 統合データベース講習会 AJACS4 蝦夷 - 研究開発創作日誌
  2. 「オープンバイオ講習会」 東京大学医科学研究所 ヒトゲノム解析センター - 研究開発創作日誌

口頭発表

  1. 中尾光輝「DAS workshop 2008 参加報告」第３７回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）（オープンバイオ研究会と共催） - 研究開発創作日誌
  2. 中尾光輝 DAS workshop 2008 参加報告 @ DBCLS - 研究開発創作日誌
  3. 中尾光輝「研究会やセミナーをUstreamするとよい」、第１０回オープンバイオ研究会ライトニングトーク - 研究開発創作日誌
  4. 中尾光輝「TogoWS」、第１０回オープンバイオ研究会ライトニングトーク - 研究開発創作日誌
  5. 中尾光輝「研究会やセミナーをUstreamするとよい」、第１０回オープンバイオ研究会ライトニングトーク - 研究開発創作日誌

ポスター発表

  1. Nakao Mitsuteru, Shinobu Okamoto and Yasukazu Nakamura, Kazusa annotation―A gene anotationtool based on social bookmark and web annotation technologies - 研究開発創作日誌
  2. 中尾光輝、岡本忍、藤沢貴智、中村保一（かずさDNA研究所）かずさアノテーション：持続可能な遺伝子アノテーション整備のための新型システム - 研究開発創作日誌

研究会・会議企画運営

  1. BioHackation 2008
  2. 第９回オープンバイオ研究会
  3. 日本 Ruby 会議 2008
  4. ゲノム情報利用ワークショップ 2008
  5. 第１０回オープンバイオ研究会

競争的研究資金

なし

オープンソース

  1. GitHub - nakao/bioruby: bioruby
  2. GitHub - nakao/proserver-netinstaller: Netinstaller for ProServer (Bio-Das-ProServer) with BioPerl and Perl Modules.
  3. Galaxy i18n

インタビュー

  1. BTJジャーナル 2008年4月号

ふりかえり

Keep
  1. 原著論文にからむ
  2. 会議を企画運営する
Problem
  1. 筆頭原著論文が出版されない
Try
  1. 原著論文を出版する