2006-07-01から1ヶ月間の記事一覧

UniProt/SwissProt を ActiveRecord でモデル化

BioRuby

タンパク質知識ベース UniProt/SwissProt を ActiveRecord でモデル化してみました．ActiveRecord は Ruby on Rails を構成する O/R マッパーです．ActiveRecord でどのようにして UniProt のエントリをモデル化の一例を解説します． モデル設計 UniProt/Swi…

bioruby-1.0 on Fink

BioRuby

Mac OS X 用のパッケージ管理プロジェクト Fink の bioruby-rb18 が bioruby-1.0 になりました． Fink - Package Database - Package bioruby-rb18 (Bioinformatics environment for ruby) Fink - Home

Takeda JI, Suzuki Y, Nakao M, Barrero RA, Koyanagi KO, Jin L, Motono C, Hata H, Isogai T, Nagai K, Otsuki T, Kuryshev V, Shionyu M, Yura K, Go M, Thierry-Mieg J, Thierry-Mieg D, Wiemann S, Nomura N, Sugano S, Gojobori T, Imanishi T. (2006) Large-scale id

査読付き論文 引用

Imanishi et al., 2004のデータ解析でお手伝いをした論文がアクセプトされました．貢献したところは，おもに，選択的スプラシシングの影響を受けるエクソンと影響を受ける機能ドメインの関連 P 値の計算についてです． Abstract Full text PDF PMID: 16914452…