2008-12-01から1ヶ月間の記事一覧

2008年の活動

2008年の活動をふりかえります。 原著論文 OUP | Not Found - 研究開発創作日誌 Low conservation and species-specific evolution of alternative splicing in humans and mice: comparative genomics analysis using well-annotated full-length cDNAs | N…

TogoWS を R からつかってみる。

R で TogoWS をつかってみます。TogoWS REST API 経由での利用によって、データベースレコードのフィールドの値が簡単に取り出せます。 関数定義 library(RCurl) togows_entry <- function(query_string) { base_url <- "http://togows.dbcls.jp/entry" url …

第10回オープンバイオ研究会の配信システム

第10回オープンバイオ研究会を配信しました。 http://www.ustream.tv/recorded/978035 配信システムはいままでの利用実績のある構成とかわりません。 http://navi.kazusa.or.jp/mod/forum/906.html id:nakao_mitsuteru:20080711:gisw2008ust id:nakao_mits…

中尾光輝「Galaxyの紹介」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

ゲノム解析ワークフロー Galaxy を紹介しました。くわしくはスクリーンキャストを見てください。録画の 01:30 から 01:39 あたりです。 Galaxy Galaxy Community Hub http://g6.kazusa.or.jp 国際化作業してます。 http://www.ustream.tv/recorded/978035

中尾光輝「TogoWS」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

SOAP でのウェブサービスのプロキシサービスと REST API の TogoWS を紹介しました。録画の 01:15 から 01:30 あたりです。 http://togows.dbcls.jp/site/rest.html http://www.ustream.tv/recorded/978035

中尾光輝「研究会やセミナーをUstreamするとよい」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

Ustream でセミナーや研究会を配信するとよいという内容です。ほとんど機材の説明をしています。録画の 01:07 から 01:15 あたりです。 http://www.ustream.tv/recorded/978035 http://navi.kazusa.or.jp/mod/forum/906.html

第10回オープンバイオ研究会を開催

JSBi2008 の会場で第10回オープンバイオ研究会を開催しました。メインセッションと同時刻に開催したので、集まりは例年と比べると1/3ほどの約10名でした。事前に募集していたトピックやライトニングトークをフリーな感じですすめました。 松田研究室 …

中尾光輝、岡本忍、藤沢貴智、中村保一(かずさDNA研究所)かずさアノテーション:持続可能な遺伝子アノテーション整備のための新型システム

2008/12/09-12に神戸で開催されたBMB2008でポスター発表をしました。 かずさアノテーション:持続可能な遺伝子アノテーション整備のための新型システム Kazusa Annotation suite: new generation gene annotation system. 中尾光輝、岡本忍、藤沢貴智、中村…