2009-06-12

BioHackathon 2009実行委員会「BioHackathon 2009 レポート」統合データベースプロジェクトシンポジウム2009

ポスター発表 biohackathon-2009 TogoDB

文科省統合データベースプロジェクトのシンポジウムでBioHackathon 2009 実行委員会としてポスター発表しました。

タイトル
BioHackathon 2009 レポート
名前
○中尾光輝1)，BioHackathon 2009 実行委員会1,2,3)
所属
1)情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター，2)沖縄科学技術研究基盤整備機構，3)東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター
要旨
BioHackathon 2009 は、沖縄科学技術研究基盤整備機構 OIST とライフサイエンス統合データベースセンターDBCLSの共催で２００９年３月に沖縄県恩納村 OIST Seaside Houseにて開催された、国内外から５０人以上のライフサイエンス研究者、バイオインフォマティクス研究者、サービス提供者、開発者を招待し、次世代シーケンサからの巨大データ処理の上流から下流にわたる解析、アノテーション維持、データ共有、ワークフロー構築にまつわる困難さに標準化、可視化、ウェブサービス、相互運用性技術やセマンティクウェブ技術を用いて取り組む合宿型研究会である。扱ったトピックは多岐に渡り、具体的に直面している課題についての議論や意見交換が行われ、集中的に取り組み、具体的なプロダクトやコラボレーションにつながる非常に生産性の高い研究会となった。そのレポートをおこなう。開催時のまとめWiki を公開している： http://hackathon2.dbcls.jp
http://togodb.dbcls.jp/symposium2009/show/78

予稿集のサイトは TogoDB を活用して川本さんが構築されました。すばらしい。

2009-05-12

仲里猛留、坂東明日佳、坊農秀雅、全弘宇、藤枝香、畠中秀樹、平井信一、川本祥子、河野信、高祖歩美、熊谷禎洋、箕輪真理、三橋信孝、永井啓一、中尾光輝、西川哲夫、岡本忍、小野浩雅、大内田賢太、谷口仁、山口敦子、山本泰智、八塚茂、大久保公策、高木利久　統合データベースポータル「統合ホームページ」 lifesciencedb.jp　第９回日本分子生物学会春季シンポジウム、2009.5.12-13、宮崎

ポスター発表

仲里さんが宮崎で開催された第９回日本分子生物学会春季シンポジウムにてポスター発表いたしました。

2009-04-01

財団法人かずさディー・エヌ・エー研究所の客員研究員になりました

退職後もバクテリアゲノムや植物ゲノムデータ、アノテーションの研究で協力関係をつづけます。

2009-04-01

大学共同利用機関法人情報・システム機構ライフサイエンス統合データベースセンターの特任研究員なりました

大学共同利用法人情報・システム研究機構（ROIS）ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）の特任研究員になりました。

新しい事をやる時に　成功は約束されていないけど　成長は約束されているから頑張れる。

という心持ちです。

2009-03-31

かずさディー・エヌ・エー研究所を退職

任期満了につき、かずさディー・エヌ・エー研究所を退職しました。

2009-03-28

第１１回オープンバイオ研究会を開催しました

オープンバイオ会議企画司会

2009/03/27-28に人工知能学会分子生物情報研究会（SIG-MBI）と共催で第１１回オープンバイオ研究会を開催しました。

今回は４コマプレゼンポスターという発表形式でおこないました。４コマプレゼンポスター形式は今回の研究会のために発案されたものです。これまでのハンズオンセミナー、オープンスペースやプログラミングコンテストなどを経て、あたらしい地平をめざしてみました。

参加者はもれなく４コマポスタープレゼンをしていただきます。４コマプレゼンとは、誰が思いついたかしらないが、起承転結のようにストーリーを四枚の画面で発表するプレゼン技法です。ポスターとしてA4四枚やA4両面二枚に印刷して持参していただきます。もちろん、４台の MacBook を持ち込んで並べるなど創意工夫も歓迎します。
３月２７日２８日に第１１回オープンバイオ研究会を開催します。 - 研究開発創作日誌

参加者の皆様はポスターをちゃんと紙に印刷して持参しており、会場には書画カメラが設置されていたので、全員にプレビューしていただきました。ちょうどA4 ４枚持参しているので、だいたい一人５分くらいのライトニングトークのようにスムーズな進行でこれはいいかんじ。参加者が11人でしたので、ちょうど一時間で終了。

プレビュー後は、パネルに掲示して、普通のポスターセッションを行いました。さきほどのプレビューが自己紹介として良い方向に作用してポスターでの議論が盛んに行われていました。

ポスターセッションの全員プレビューといえば、恵比寿時代のGIWが思い出されます。あのころは、OHP一枚もって一列に並んで、１分くらい述べるのが一時間くらい続くなかなかつらい時間でしたが、いい経験だったとおもいます。

４コマプレゼンポスター形式は、今回は参加者の盛り上がりから成功したといえます。ふつうのポスターセッションでも、トークでも達成できないコミュニケーションが達成できました。１０名くらいの規模で研究交流会をするときに有効な形式であるとおもいました。

似たような形式としては、ポジションペーパ形式やライトニングトークがあげられます。わりときつい制約があるのは共通点です。ちがいは、ポジションペーパーは一枚で全員に配布しなければいけないし、ライトニングトークは５分間という時間が重視されています。

４コマプレゼンポスター形式はポータブルであるといえます。今回はパネルを準備していただけましたが、４枚程度だと、机にならべても十分閲覧できるので、場所を選ばない形式かもしれません。また、プレビューのための書画カメラが準備できないときは、印刷と同時にPDFにも出力しておけば、通常のプロジェクタでもプレゼンが可能です。機材の要求が低いというのも良い点だといえます。

KPT

Keep

研究会を開催する。
４コマポスター＋全員プレビュー。

Problem

当日まで進行がきまっていなかった。

Try

事前に進行を考えておく。

2009-03-22

BioHackathon 2009 のふりかえり

biohackathon-2009

あとでかく。