2009/03/27-28に人工知能学会分子生物情報研究会（SIG-MBI）と共催で第１１回オープンバイオ研究会を開催しました。 http://www.jaist.ac.jp/~ken/sigmbi/ http://open-bio.jp/?meeting11 http://open-bio.jp/?meeting11-abstract 今回は４コマプレゼンポス…

第４０回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）との共催で第１１回オープンバイオ研究会を開催します。 参加者はもれなく４コマポスタープレゼンをしていただきます。４コマプレゼンとは、誰が思いついたかしらないが、起承転結のようにストーリーを…

12月16日に千里ライフサイエンスセンターで開催される JSBi2008 内の自由集会として、第１０回オープンバイオ研究会を開催いたします。 http://open-bio.jp/?meeting10 松田研究室 今回もオープンスペースをおこないます。話題のある方はぜひご参加ください…

タイトル DAS workshop 2008 参加報告 講演者 ○中尾光輝（かずさディー・エヌ・エー研究所） 講演概要 DAS workshop 2008に参加してきました。ゲノム配列と遺伝子のアノテーションの共有プロトコルとして、ヨーロッパを中心に利用実績がとてもたかまっている…

id:nakao_mitsuteru:20080202:BioHackathon2008 で告知していた BioHackathon 2008 を ustream.tv で中継しています。 BioHackathon 2008 Tokyobiohackathon2008

2008-02-11から15まで、東京で BioHackathon 2008 が開催されます。 Web Service BioHackathon 2008 のご案内 Web Service Hackathon 開催趣旨 国内外から（１）バイオ系ウェブサービス提供サイト開発者、（２）Open Bio*開発者、（３）ワークフロー構築のた…

お台場の科学未来館で開催中の JSBi2007 のポスターセッションと並行して、第８回オープンバイオ研究会を開催しました。JSBi2007の事務局のかたのご協力でスムーズに開催することができました。ありがとうございます。 http://zp.cbrc.jp/jsbi2007 http://op…

第８回オープンバイオ研究会のご案内をいたします。来る 12/18 にお台場の科学未来館で開催される JSBi2007 にて第８回オープンバイオ研究会をおこないます。 http://zp.cbrc.jp/jsbi2007 http://open-bio.jp/?meeting8 今回は発表形式ではなく、第３回、第…

第7回オープンバイオ研究会@Apple store Ginzaでライトニングトークをしてきました。 http://open-bio.jp/?meeting7 17:25-17:30 コドン表の可視化技法 講演者 中尾光輝（財団法人 かずさディー・エヌ・エー研究所）講演概要 コドン表の可視化技法の開発から…

emboss 3.0.0 は MacPorts にあるけど、なぜかソースがダウンロードできないので，つい emboss 4.1.0 の Portfile を作った．（中略）．emboss 3.0.0 用のPortfileを参考にしている．versionとmaster_sitesとchecksumsを変更しただけとも言う．emboss 3.0.0 …

MacPorts として Bioperl 1.5.2 をインストールしたかったので、Bioperl 用の Portfile をつくってみた。依存関係（depends_lib-append）の煮詰めが若干甘いとおもうけど、自分の環境ではインストールできたようで、bp_glyphs1-demo.pl が動作した。Back in …

2007/03/02-2007/03/03に北陸先端大学院大学（JAIST）で開催された第３５回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）＋第６回オープンバイオ研究に参加しました。 分子生物情報研究会 (SIG-MBI) http://www.sigmbi.jp/35.html http://open-bio.jp/?meeti…

2007/02/01-02 にオークラアカデミアパークホテルでゲノム情報利用ワークショップが開催されます．今回はJSBi機能ゲノミクス研究会と合同開催となります． ゲノム情報利用ワークショップ2007 かずさDNA研究所ワークショップ / プログラム 会場までは東京駅か…

2006/12/18-20 に横浜で開催された GIW2006 にて第５回オープンバイオ研究会を開催しました．今回は，第３回でおこなったオープンスペース形式再びです． http://open-bio.jp/hiki.cgi?meeting5 http://open-bio.sourceforge.jp/?meeting5-openspace-log 今…

タイトル：ActiveRecord によるバイオデータベースモデリング：UniProtとGO DatabaseとGFFの場合 http://open-bio.sourceforge.jp/hiki.cgi?meeting4-slides http://open-bio.sourceforge.jp/archive/20061031_OB4/OB4-ActiveRecord-Nakao.pdf http://open-b…

ライトニングトークで発表してきました．(あとで書く)

2006/08/04-05 にブラジルのフォルタレザで開催された BOSC2006 に参加してきました．BOSC2006 は ISMB2006 の SIG として開催されました． BOSC 2006 - Open Bioinformatics Foundation

BioMed Central にて，医学生物学分野のソースコードをあつかうジャーナルが創刊されることに．たいへん興味深い． Source Code for Biology and Medicine | Home page BMC, research in progress YOKOFAKUN: New BMC Journal: "Source Code for Biology and…

ライトニングトークをしてきました． http://open-bio.jp/hiki.cgi?meeting2 http://b-src.cbrc.jp プレゼンテーションには TMPresents.app を使用して，DSS (Domain Specific Services) なる造語を連発しつつ，10 分で 98 枚のスライドと命名の話とデモを駆…

2005/12/19 にパシフィコ横浜で開催される GIW2005 にて昨年にひきつづきオープンバイオ研究会が開催されます．今年も Call for BoFs のお願いをしてみたところ開催することができました． http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2005/ http://giw.ims.u-tokyo.ac…