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The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications, Journal of Biomedical Semantics 2011, 2:4

論文 査読付き論文

バイオハッカソン2009の活動報告としてのレビュー論文が出版されました。 Review The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applicationsToshiaki Katayama*, Mark D Wilkinson, Rutger Vos, Takeshi Kawashim…

BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language, Bioinformatics (2010) 26 (20): 2617-2619.

論文 査読付き論文

BioRuby の論文が出版されました。 Bioinformatics. 2010 Oct 15;26(20):2617-9. Epub 2010 Aug 25. BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language. Goto N, Prins P, Nakao M, Bonnal R, Aerts J, Katayama T. http://bioinformatic…

中尾光輝、片山俊明「1. 分散データの統合とセマンティック Web」情報処理学会誌９月号, 836-844, 小特集: 生命情報学が直面する大規模ゲノムデータ時代の課題

出版 論文 biohackathon-2009

情報処理学会誌９月号小特集: 生命情報学が直面する大規模ゲノムデータ時代の課題に BioHackathon 2009 での議論を踏まえた記事を書きました。BioHackathon 2008 と 2009 でおこなってきたライフサイエンスにおけるウェブサービスの相互運用性向上による統合…

Goto, N., Nakao, M.C., Kawashima, S., Katayama, T., and Kanehisa, M.; BioRuby: open-source bioinformatics library. Genome Informatics 14, 629-630 (2003).

会議 ポスター 論文 発表

GIW 2003 でポスター発表しました。 pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2003/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2003/accepted_poster.htm

Katayama, T., Kawashima, S., Goto, N., Nakao, M.C., Okuji, Y.K., and Kanehisa, M.; BioRuby: object oriented open source library for bioinformatics. Genome Informatics 13, 248-249 (2002).

会議 デモ 論文 発表

http://www.jsbi.org/journal/GIW02/GIW02SS05.pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/softdemo.htm

Mitsuteru C. Nakao Kenta Nakai; Improvement of PSORT II Protein Sorting Prediction for Mammalian Proteins. Genome Informatics 13, 441-442 (2002).

会議 ポスター 論文 発表

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/Poster.htm

Nakao, M., Okuji, Y., and Kanehisa, M.; Quantitative estimation of cross-hybridization in DNA microarrays based on a linear model. Genome Informatics 11, 231-232 (2000).

会議 ポスター 論文 発表

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2000/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2000/accepted-posters.html

Nakao, M., Sato, K., Kamiya, T., Kimura, Y., and Kanehisa, M.; Genome-scale gene expression profiles mapped onto the pathway and genome maps in KEGG. Genome Informatics 9, 230-231 (1998).

会議 ポスター 論文 発表

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw98/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw98/cdrom/softdemo.html