b-Src のサーバシステムを更新

http://b-src.cbrc.jp の中の gonzui の db インデクスが不安定だったので、関連パッケージを再インストールしました。

bdb-5.8 拡張ライブラリのコンパイルがどうしても解決できなかったので、ruby 1.9 の利用は廃止し、ruby 1.8.7 を使用しました。こちらは MacPorts でインストールしました。

gonzui-1.2 と langscan-1.2 を再インストールしました。

しばらく不安定だった http://b-src.cbrc.jp ですが、これで安定稼働が期待できます。今後は登録パッケージを安定的に増やしていきたいです。

登録してあるパッケージは現在 207 個です。管理者としてみると、どのパッケージがどのようなものかはすべて把握しているのですが、利用者の多くの方にとっては、パッケージの名前だけみてもわからないものだとおもわれます。実際の利用のときは、特定のプログラム、例えば blastall、のソースを見たいときは、トップページからブラウズしてもおそらく ncbi の中にあるとは気がつかないでしょう。そのようなときは検索してからブラウズするとよいのですが、ディレクトリサービス的に分類整理されて、たどりたいという要望が自然だという考え方もあるようです。それをうけて、なんらかの分類付けやソースの在処など登録パッケージのメタデータを書き留める Wiki があると良いというアイデアを検討しています。