http://b-src.cbrc.jp の中の gonzui の db インデクスが不安定だったので、関連パッケージを再インストールしました。 bdb-5.8 拡張ライブラリのコンパイルがどうしても解決できなかったので、ruby 1.9 の利用は廃止し、ruby 1.8.7 を使用しました。こちら…

b-Src は ruby 1.9 で動いています。最近落ちることが頻繁になってきたので、最新版に更新して様子をみてみます。 ruby 1.9 のソースコードの取得 Ruby Core を参考にして、trunk 取得します。 $ svn co http://svn.ruby-lang.org/repos/ruby/trunk ruby コ…

elgg を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/elgg ソースコードは次のようにして取得しました。 mkdir elgg cd elgg mkdir elgg cd elgg svn co svn://svn.elgg.net/elgg/devel/ cd .. svn co svn://svn.elgg.net/plugins/…

ext-1.0.1 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/ext-1.1-beta2 ソースコードは次のようにして取得しました。 curl -O http://extjs.com/deploy/ext-1.1-beta2.zip Sencha - Sencha.com | Sencha.com Free Sencha Product…

ext-1.0.1 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/ext-1.0.1 ソースコードは次のようにして取得しました。 curl -O http://extjs.com/deploy/ext-1.0.1a.zip Sencha - Sencha.com | Sencha.com Free Sencha Product Trials…

Yahoo! UI Library (YUI) を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/yui ソースコードは次のようにして取得しました。 open http://developer.yahoo.com/yui/download/SourceForge へリダイレクトされます。 http://developer…

Bioconductor の Subversion レポジトリ Rpacks を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/Rpacks ソースコードは次のようにして取得しました。 svn co https://hedgehog.fhcrc.org/bioconductor/trunk/madman/Rpacks/ http:/…

R-2.5.0 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/R-2.5.0 ソースコードは次のようにして取得しました。 curl -O http://cran.r-project.org/src/base/R-2/R-2.5.0.tar.gz The Comprehensive R Archive Network

BioRails を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/biorails ソースコードは次のようにして取得しました。 svn co http://biorails.org/svn/biorails Edge Support Drug discovery informatics Services - The Edge Software…

jruby-1.0.0RC1 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/jruby-src-1.0.0RC1 ソースコードは次のようにして取得しました。 curl -O http://dist.codehaus.org/jruby/jruby-src-1.0.0RC1.tar.gz http://jruby.codehaus.org/

biomart-perl release-0_5 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/biomart-perl ソースコードは次のようにして取得しました。 cvs -d :pserver:cvsuser@cvs.sanger.ac.uk:/cvsroot/biomart login cvs -d :pserver:cvsuser@…

martj release-0_5 を http://b-src.cbrc.jp/ に追加しました。 http://b-src.cbrc.jp/markup/martj ソースコードは次のようにして取得しました。 cvs -d :pserver:cvsuser@cvs.sanger.ac.uk:/cvsroot/biomart login cvs -d :pserver:cvsuser@cvs.sanger.ac.…

BoF のあとにメールを確認していてわかったことですが，サーバ強化のための提案を採択していただけたので，これからサーバマシンの強化をおこないます． http://b-src.cbrc.jp

ライトニングトークをしてきました． http://open-bio.jp/hiki.cgi?meeting2 http://b-src.cbrc.jp プレゼンテーションには TMPresents.app を使用して，DSS (Domain Specific Services) なる造語を連発しつつ，10 分で 98 枚のスライドと命名の話とデモを駆…