口頭

「データ統合とサイバーインフラストラクチャ」JSBi 第1回 応用システムバイオロジー研究会

応用システムバイオロジー研究会で講演しました。 データ統合とサイバーインフラストラクチャ View more presentations from Mitsuteru Nakao JSBi 第1回 応用システムバイオロジー研究会 プログラム http://togodb.dbcls.jp/TBA/

中尾光輝「ライフサイエンス統合データベースの課題:権利と法律、技術」CBRCワークショップII, Bioinformatics Week in Odaiba 2009

BiWO2009 の情報統合データベースのセッションで講演しました。ライフサイエンス統合データベースの課題:権利と法律、技術View more documents from Database Center for Life Science (DBCLS).ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)の活動の…

中尾光輝「BioHackathon 2009 レポート」第23回システムバイオロジー研究会

東大医科研で開催された第23回システムバイオロジー研究会にて BioHakcathon 2009 の発表をしてきました。オーガナイザーの理研の川路さん、ありがとうございます。 BioHackathon 2009 レポート 中尾光輝 (ライフサイエンス統合データベースセンター)ライ…

中尾光輝、金子貴一、小原光代、岡本忍、藤澤貴智、田畑哲之、中村保一「CyanoBaseとRhizoBase:新型微生物ゲノムデータベース」第3回日本ゲノム微生物学会年会

2009/03/05-07に中央大学後楽園キャンパスで開催された第3回日本ゲノム微生物学会年会のセッション 7 - 5 データベースで口頭発表をしました。口頭発表者もポスターを掲示できるのでポスターの掲示をおこないました。 7502 CyanoBaseとRhizoBase:新型微生…

中尾光輝「Galaxyの紹介」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

ゲノム解析ワークフロー Galaxy を紹介しました。くわしくはスクリーンキャストを見てください。録画の 01:30 から 01:39 あたりです。 Galaxy Galaxy Community Hub http://g6.kazusa.or.jp 国際化作業してます。 http://www.ustream.tv/recorded/978035

中尾光輝「TogoWS」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

SOAP でのウェブサービスのプロキシサービスと REST API の TogoWS を紹介しました。録画の 01:15 から 01:30 あたりです。 http://togows.dbcls.jp/site/rest.html http://www.ustream.tv/recorded/978035

中尾光輝「研究会やセミナーをUstreamするとよい」、第10回オープンバイオ研究会ライトニングトーク

Ustream でセミナーや研究会を配信するとよいという内容です。ほとんど機材の説明をしています。録画の 01:07 から 01:15 あたりです。 http://www.ustream.tv/recorded/978035 http://navi.kazusa.or.jp/mod/forum/906.html

第10回オープンバイオ研究会を開催

JSBi2008 の会場で第10回オープンバイオ研究会を開催しました。メインセッションと同時刻に開催したので、集まりは例年と比べると1/3ほどの約10名でした。事前に募集していたトピックやライトニングトークをフリーな感じですすめました。 松田研究室 …

中尾光輝 DAS workshop 2008 参加報告 @ DBCLS

DBCLS で DAS のセミナーをしてきました。国内での DAS の利用がもっと普及すればいいと思うのでぼくは押し進めます、協力してください、という内容のセミナーです。もうひとつの結論は、ウェブサービスだけではだめで、それをとりまく部分の仕様も決まって…

中尾光輝「DAS workshop 2008 参加報告」第37回 人工知能学会 分子生物情報研究会(SIG-MBI)(オープンバイオ研究会と共催)

タイトル DAS workshop 2008 参加報告 講演者 ○中尾光輝(かずさディー・エヌ・エー研究所) 講演概要 DAS workshop 2008に参加してきました。ゲノム配列と遺伝子のアノテーションの共有プロトコルとして、ヨーロッパを中心に利用実績がとてもたかまっている…

中尾、中村「コドン表の可視化技法」第7回オープンバイオ研究会

第7回オープンバイオ研究会@Apple store Ginzaでライトニングトークをしてきました。 http://open-bio.jp/?meeting7 17:25-17:30 コドン表の可視化技法 講演者 中尾光輝(財団法人 かずさディー・エヌ・エー研究所)講演概要 コドン表の可視化技法の開発から…

ソーシャル・ゲノム・アノテーション @ CBRC

セミナーのスライドを SlideShare で公開しました。 質問 Q かずさのブックマークはどんなものか見せて A スクリーンショットを見せました Q 遺伝子の概念はどうするのか?選択的スプライシング産物のアノテーションなど A 遺伝子シンボルがあればそれをつか…

Bioconductor チュートリアル @ NIG

国立遺伝学研究所で Bioconductor チュートリアルをおこなってきました。 Bioconductorチュートリアル @ NIG - Bioconductorノート - bioconductorグループ はじめに - Bioconductorノート - bioconductorグループ R の導入について - Bioconductorノート - …

中尾光輝、Kazusa API - ウェブサービスAPIを中規模公開データベースに追加する事例として

d:id:nakao_mitsuteru:20070307:p1で告知していた、東京大学医科学研究所で開催された「生物情報の相互運用性 2007」にて30分の発表をしてきました. http://www.event.nig.ac.jp/db/db2007/ 中尾光輝、Kazusa API - ウェブサービスAPIを中規模公開データベ…

中尾光輝、Kazusa API 制作日誌

JSBi機能ゲノミクス研究会 第1回研究会/ゲノム情報利用ワークショップ2007「ゲノムアノテーションとWebサービス」で口頭発表しました。2/1から2/2にかずさアークホテルオークラで開催されたゲノム情報利用ワークショップ2007を開催してきました。今回は、…

Mitsuteru Nakao, b-src.cbrc.jp: a source-code srarch for bioinformatics packages

ライトニングトークで発表してきました.(あとで書く)

Mitsuteru Nakao, Large-scale analysis of human alternative protein isoforms

(書きかけです) ESF-JSPS Follow-Up Workshop on Functional Genomics - From the Bench to Bioinformatics - で口頭発表してきました.

「b-src: バイオインフォマティクス専用ソースコード検索サーバ」

ライトニングトークをしてきました. http://open-bio.jp/hiki.cgi?meeting2 http://b-src.cbrc.jp プレゼンテーションには TMPresents.app を使用して,DSS (Domain Specific Services) なる造語を連発しつつ,10 分で 98 枚のスライドと命名の話とデモを駆…

中尾光輝、細胞内局在等タンパク質機能に関する推定の原理とツール

日本光合成研究会ワークショップ「光合成研究者にもわかる・役立つバイオインフォマティクス」で講演してきました。

中尾光輝、 R と PSORTII

infobiologist: meeting Jan 2003 @ NIG

Mitsuteru Nakao and Kenta Nakai, Localizome analysis with PSORT II

パネルディスカッション「ゲノム時代のデータベース」

ITBL にパネルディスカッション「ゲノム時代のデータベース」のパネラーとして参加しました。話題提供スライドのフルスクリプト BioRuby Project http://bioruby.org オブジェクト指向スクリプト言語 Ruby による Bioinformatics のためのオープンソースライ…

Mitsuteru Nakao, Hidemasa Bono, Shuichi Kawashima, Tomomi Kamiya, Kazushige Sato, Susumu Goto, Minoru Kanehisa (1999) Genome-scale Gene Expression Analysis and Pathway Reconstruction in KEGG, Genome Informatics 10: 94-103

Abstract PDF http://www.jsbi.org/journal/GI10.html PMID:11072346 http://scholar.google.com/scholar?q=author:%22Nakao%22+intitle:%22Genome-scale+gene+expression+analysis+and+pathway+...%22+&hl=ja&c2coff=1&pwst=1&um=1&oi=scholarr