R で TogoWS をつかってみます。TogoWS REST API 経由での利用によって、データベースレコードのフィールドの値が簡単に取り出せます。 関数定義 library(RCurl) togows_entry <- function(query_string) { base_url <- "http://togows.dbcls.jp/entry" url …

2/25-26 に Hinxton のウェウカムトラスト・ゲノムキャンパスで開催された DAS workshop 2008 に参加しました。一日目 25 日は一般公募したセミナーで、二日目 26 日はハンズオンセミナーでした。 DAS workshop は例年おこなわれていて、昨年 も Hinxton で…

id:nakao_mitsuteru:20080202:BioHackathon2008 で告知していた BioHackathon 2008 を ustream.tv で中継しています。 BioHackathon 2008 Tokyobiohackathon2008

2008-02-11から15まで、東京で BioHackathon 2008 が開催されます。 Web Service BioHackathon 2008 のご案内 Web Service Hackathon 開催趣旨 国内外から（１）バイオ系ウェブサービス提供サイト開発者、（２）Open Bio*開発者、（３）ワークフロー構築のた…

WSDL の提供されているウェブサービスは Taverna で容易に追加して扱うことができる．id:nakao_mitsuteru:20060511:AWS でウェブサービス API を追加した expview を試してみた． Apache Taverna - Apache Taverna (incubating) http://itoshi.tv/d/?date=20…

（書きかけです） taverna-workbench-1.3.1-tutorial.pdf を試してみた．Taverna ワークベンチソフトウェアは，バイオインフォマティクス分野に特化したワークフローに関する複雑な in silico 実験の構築を可能にします．ワークフローやパイプラインを作成し…