会議

S02 b-Src: A Source-Code Search Engine for Bioinformatics Open-Source Packages Mitsuteru Nakao, Paul Horton

GIW2005 でソフトデモしました。 http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2005/softdemo.html http://b-src.cbrc.jp 二枚分パネルに机二つとコンセントとネットを確保.そちらに A0 サイズのポスターを一枚掲示し,ハンドアウトを机に置いた.いつのまにかバイオイ…

「b-src: バイオインフォマティクス専用ソースコード検索サーバ」

ライトニングトークをしてきました. http://open-bio.jp/hiki.cgi?meeting2 http://b-src.cbrc.jp プレゼンテーションには TMPresents.app を使用して,DSS (Domain Specific Services) なる造語を連発しつつ,10 分で 98 枚のスライドと命名の話とデモを駆…

KEGG 10 周年シンポジウム

2005/12/15-16 に京都で開催された KEGG 10 周年シンポジウムに参加. International Symposium From Genomics to Chemical Genomics: 10th Anniversary of KEGG International Symposium From Genomics to Chemical Genomics: 10th Anniversary of KEGG -Pr…

2P-0018 中尾 光輝; 中井 謙太; ホートン ポール; 選択的タンパク質アイソフォームの分類と局在化シグナルとの関連

● 一般演題(ポスター)番号: "2P-0018"(第 2 日) 著者:中尾 光輝; 中井 謙太; ホートン ポール; 演題:選択的タンパク質アイソフォームの分類と局在化シグナルとの関連

MBSJ 2005

2005/12/07 から福岡ドーム界隈で MBSJ 2005 が開催.ポスター発表(2P-0016,2P-0018)で参加します. http://aeplan.co.jp/mbsj2005/ http://aeplan.co.jp/mbsj2005/program.html Google マップ Google マップ キーワード検索と著者索引がウェブで公開され…

BioPAX ハッカーソンとワークショップとシンポジウムと

2005/11/15 から 18 までお台場の産総研で開催された BioPAX のイベントに潜入. BioPAX (on Github) http://www.biopax.org/About.html Journal of Commercial Biotechnology ハッカーソン Journal of Commercial Biotechnology 10分ほど潜伏してみたところ…

GIW2005 BoFs でオープンバイオ研究会開催 2005/12/19

2005/12/19 にパシフィコ横浜で開催される GIW2005 にて昨年にひきつづきオープンバイオ研究会が開催されます.今年も Call for BoFs のお願いをしてみたところ開催することができました. http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2005/ http://giw.ims.u-tokyo.ac…

Mitsuteru Nakao1, Keun-Joon Park2, Paul Horton; A Knowledge base for the Protein Localizome; ISMB/ECCB2004

http://www.iscb.org/ismb2004/posters/nakao-mitsuteruATaist.go.jp_879.html http://www.iscb.org/ismb2004/

Goto, N., Nakao, M.C., Kawashima, S., Katayama, T., and Kanehisa, M.; BioRuby: open-source bioinformatics library. Genome Informatics 14, 629-630 (2003).

GIW 2003 でポスター発表しました。 pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2003/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2003/accepted_poster.htm

中尾光輝、細胞内局在等タンパク質機能に関する推定の原理とツール

日本光合成研究会ワークショップ「光合成研究者にもわかる・役立つバイオインフォマティクス」で講演してきました。

中尾光輝、 R と PSORTII

infobiologist: meeting Jan 2003 @ NIG

Katayama, T., Kawashima, S., Goto, N., Nakao, M.C., Okuji, Y.K., and Kanehisa, M.; BioRuby: object oriented open source library for bioinformatics. Genome Informatics 13, 248-249 (2002).

http://www.jsbi.org/journal/GIW02/GIW02SS05.pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/softdemo.htm

Mitsuteru C. Nakao Kenta Nakai; Improvement of PSORT II Protein Sorting Prediction for Mammalian Proteins. Genome Informatics 13, 441-442 (2002).

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2002/Poster.htm

Mitsuteru Nakao and Kenta Nakai, Localizome analysis with PSORT II

パネルディスカッション「ゲノム時代のデータベース」

ITBL にパネルディスカッション「ゲノム時代のデータベース」のパネラーとして参加しました。話題提供スライドのフルスクリプト BioRuby Project http://bioruby.org オブジェクト指向スクリプト言語 Ruby による Bioinformatics のためのオープンソースライ…

JST異分野研究者交流促進事業フォーラム「バイオインフォマティクス―バーチャル生物学への展望―」に参加

2002/03/01から03まで大仁温泉で開催されたJST異分野研究者交流促進事業フォーラム「バイオインフォマティクス―バーチャル生物学への展望―」に参加しました。

Nakao, M., Okuji, Y., and Kanehisa, M.; Quantitative estimation of cross-hybridization in DNA microarrays based on a linear model. Genome Informatics 11, 231-232 (2000).

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2000/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2000/accepted-posters.html

Mitsuteru Nakao, Hidemasa Bono, Shuichi Kawashima, Tomomi Kamiya, Kazushige Sato, Susumu Goto, Minoru Kanehisa (1999) Genome-scale Gene Expression Analysis and Pathway Reconstruction in KEGG, Genome Informatics 10: 94-103

Abstract PDF http://www.jsbi.org/journal/GI10.html PMID:11072346 http://scholar.google.com/scholar?q=author:%22Nakao%22+intitle:%22Genome-scale+gene+expression+analysis+and+pathway+...%22+&hl=ja&c2coff=1&pwst=1&um=1&oi=scholarr

Nakao, M., Sato, K., Kamiya, T., Kimura, Y., and Kanehisa, M.; Genome-scale gene expression profiles mapped onto the pathway and genome maps in KEGG. Genome Informatics 9, 230-231 (1998).

pdf http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw98/ http://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw98/cdrom/softdemo.html